Gimnazija bendradarbiauja su kitomis panašaus pobūdžio mokyklomis ir organizacijomis šalyje bei užsienyje:
Nuo 1997 m. su Vilniaus krikščionių gimnazija;
Nuo 2000 m. su Išganymo Armija, LCC Universitetu;
Nuo 2004 m. su Vitės progimnazija;
Nuo 2007 m. su tarptautine organizacija Jaunimo misija (Youth with Mission);
Nuo 2010 m. su Sendvario progimnazija; su paramos organizacija NY STAR Norvegijoje;
Nuo 2014 m. su Kalvin koledžu Olandijoje;
Nuo 2015 m. su Klaipėdos Universitetu;
Nuo 2018 m. su Maltos ordinu;
Nuo 2016 m. su krikščioniškų koledžų asociacija Olandijoje;
Nuo 2017 m. su ASCI krikščioniškų švietimo įstaigų Europoje asociacija.
